В МОМ → Настройки сайта → Общие настройки есть поле Часовой пояс:
Задание часового пояса в этом поле не связано с расчетом времени автоматической аннуляции, а касается отображения рассчитанного времени автоматической отмены билетов на сайте и в письме.
Если в профиле организации/места работы пользователя на странице Прочие параметры не заполнено значение Часовая зона, то брать значение часовой зоны из Общих настроек сайта.